https://frosthead.com

Opis pierwszego gatunku kręgowca z kodem kreskowym DNA

W grudniu 1982 r. Benjamin Victor, założyciel inicjatywy badawczej rafy koralowej Ocean Science Foundation, nurkował na rafie tuż przy stacji terenowej Smithsonian Tropical Research Institute, kiedy zgarnął dorosłą babkę. Ryba wyglądała nieco inaczej niż atlantycka babka, ale jej cechy nie były na tyle wyjątkowe, aby uznać ją za nowy gatunek.

Victor podejrzewał, że różnice sięgają głęboko w skład genetyczny babki, ale zawiódł go system identyfikacji gatunków, oparty wyłącznie na fizycznych identyfikatorach, takich jak oznaczenia, liczba płetw i kształty kości. Potrzebowałby drugiej próbki i analizy DNA. Tak więc okaz siedział i siedział - właściwie na biurku Victora - przez prawie 25 lat.

W marcu 2006 roku Dave Jones z National Marine Fisheries Service zebrał okaz larwalny przypominający babkę Victora w pułapce na meksykańskim Jukatanie. Stamtąd nowa taksonomiczna technika kodów kreskowych pozwoliła Wiktorowi dopasować DNA larwy do DNA dorosłego i ogłosić babkę nowym gatunkiem, który różni się od jego babki atlantyckiej o 25 procent (pamiętaj: ludzie a szympansy różnią się tylko 1-2 procent).

Roszczenie sławy ryby polega na tym, że jej tożsamość została przyćmiona kodem kreskowym DNA. Kod kreskowy, pobrany z ustalonej lokalizacji w genomie, działa jak kod kreskowy produktu konsumpcyjnego, ponieważ uszczelnia ofertę pod względem identyfikacji.

Babka o imieniu Coryphopterus kuna stała się pierwszym gatunkiem kręgowca, którego kod kreskowy DNA został zawarty w oficjalnym opisie gatunku. Około 30 000 znanych gatunków, od grzybów po ptaki, zostało opatrzonych kodem kreskowym, ale we wszystkich przypadkach gatunki zostały odnalezione i naukowo opisane przed utworzeniem kodów kreskowych. Inicjatywa Barcode of Life, której partnerem jest Smithsonian Institution, wzywa do zebrania krótkich nici DNA i umieszczenia ich w bazie danych o otwartym dostępie.

„Nie było sposobu, aby ułatwić i konsekwentnie zidentyfikować rybę. Zwykle musiałeś być ekspertem i musiałbyś mieć dobrego dorosłego osobnika do zbadania, a potem była to twoja opinia”, mówi Victor z taksonomii przed kodem kreskowym. „Teraz każdy, kto ma dostęp do technologii kodów kreskowych, może powiedzieć z całą pewnością, że sekwencja pasuje do gatunku X, nawet jeśli to, co masz, to jajko, larwa, łuska lub kawałek skóry”.

(Dzięki uprzejmości STRI)

Opis pierwszego gatunku kręgowca z kodem kreskowym DNA